Лабораторія екології тварин
- Бокотей А.А., Соколов Н.Ю. Каталог орнітологічної колекції Державного природознавчого музею. – Львів, 2000. – 164 с.
- Фесенко Г.В., Бокотей А.А. Птахи фауни України. – Київ, 2002. – 416 с.
- Фесенко Г.В., Бокотей А.А. Анотований список українських наукових назв птахів фауни України (з характеристикою статусу видів). – Київ-Львів, 2007. – 112 с. – ISBN 966-8734-08-4
- Бокотей А.А. та ін. Гніздова орнітофауна басейну Верхнього Дністра. – Львів, 2010. – 400 с.
- Бокотей А.А. та ін. Біологічне різноманіття басейну Верхнього Дністра та проблеми його збереження. – Київ: Органік Прінт, 2011. – 72 с.
- Бокотей А.А. та ін. Лелеки, люди і енергетика: вирішення проблеми. – Львів, 2011. – 32 с.
- Bokotej A., Dziubenko N. Badania i ochrona bociana czarnego Ciconia nigra (L.) na Ukrainie // Roczniki Bieszczadzkie. – 2012. – T 20. – S. 146-155.
- Бокотей А. А., Дзюбенко Н. В. Освітня програма „Лелека”. – Львів, 2014. – 68 с.
- Konovalov A., Kaldma K., Bokotey A., Brossault P., Chapalain F., Dmitrenok M., Dzyubenko N., Sellis U., Strazds M., Strenna L., Treinys R., Zielinski P., Vali U. Spatio-temporal variation in nestling sex ratio among the Black Stork Ciconia nigra populations across Europe // Journal of Ornithology, 2015. – Vol. 156. – Р. 381-387.
- Bokotey A., Strus Iu., Dzubenko N. Nesting habitats of Black Stork in Ukrainian forest zone (Polissia) revealed by an overlay analysis in GIS // Наукові записки ДПМ. – 2017. – Т. 33. – С. 23-32. DOI: https://doi.org/10.36885/nzdpm.2017.33.23-32
- Strus Iu., Bokotey A., Dzubenko N. Detection of forest loss on Black Stork breeding sites in the Rivne region (Polissia) by a GIS analysis // Наукові записки ДПМ. – 2017. – Т. 33. – С. 75-80. DOI: https://doi.org/10.36885/nzdpm.2017.33.75-80
- Романь А.М., Франчук М.В., Бокотей А.А., Дзюбенко Н.В. Риби, як складовa раціону лелеки чорного (Сiconia nigra), у місцях його регулярного живлення // Наукові записки Державного природознавчого музею НАН України. – 2018. – Вип. 34. – С. 99-110. DOI: https://doi.org/10.36885/nzdpm.2018.34.99-110
- Бучко В.В., Бокотей А.А., Смірнов Н.А., Шумська Н.В., Заморока А.М., Дмитраш-Вацеба І.І., Скільський І.В., Дзюбенко Н.В., Струс Ю.М., Маланюк В.Б. Охоронні ділянки як механізм збереження біотичного різноманіття в лісах (на прикладі Прикарпаття). Практичний посібник. – Чернівці: Друк Арт, 2018. - 48 с.
- Пограничний В., Бокотей А., Горбань І. Станіслав Костянтин Петруський - один із засновників галицької орнітології // Вісник Музею «Дрогобиччина». – 2018. – 1. – С. 84-116.
- Бокотей А. Методичні підходи до визначення розміру охоронної ділянки навколо гнізда лелеки чорного Ciconia nigra (L.) // Науковий вісник НЛТУ України, 2019. – 29, 2. – С. 31-34. DOI: https://doi.org/10.15421/40290206
- Бокотей А.А., Дзюбенко Н.В., Драпалюк А.М. План дій щодо збереження чорного лелеки (Ciconia nigra L.) в Україні. – Львів-Київ, 2019 – 30 с.
- Майхрук М.І., Бокотей А.А. Птахи Тернопілля. – Львів, 2019. – 244 с.
- Bokotey A.A. Changes of the avifauna of Lviv (Ukraine) assessment of recent bird atlases // Ecologia urbana. 2020. 31 (1-2): 15-23.
- Dubovyk O., Bokotey A., Pokrytiuk L., Bodnar V., Strus Yu., Ruchko O. Autumn migration of birds over polonyna Borzhava (Ukrainian Carpathians) // Zoodiversity. – 2020. – 54, 1. – P. 43-52. DOI: https://doi.org/10.15407/zoo2020.01.043
- Бокотей А.А., Дзюбенко Н.В., Дубовик О.А. (2020). Репрезентативність та охорона орнітофауни Регіонального ландшафтного парку «Стільське Горбогір’я». Наукові праці Лісівничої академії наук України. 20: 45-56. DOI: https://doi.org/10.15421/412004
- Dubovyk O., Kuzyo H., Bokotey A. Density variation in “rare” breeding birds in native forests and urban parks // GEO&BIO. 2020. vol. 19 pp. 20–31 https://doi.org/10.15407/gb1904
- Бокотей А.А. Динаміка гніздової орнітофауни селітебної частини Львова за період між 2006 і 2018 роками // Наукові записки Державного природознавчого музею НАН України. – 2020. – Вип. 36. – С. 95-106. DOI: https://doi.org/10.36885/nzdpm.2020.36.95-106
- Дзюбенко Н.В., Климишин О.С., Бокотей А.А. Природничі музеї: показники ефективності та критерії оцінювання // Наукові записки Державного природознавчого музею НАН України. – 2020. – Вип. 36. – С. 15-20. DOI: https://doi.org/10.36885/nzdpm.2020.36.15-20
- Bokotey A., Hordowski J. Zbiory ornitologiczne w Muzeum Przyrodniczym we Lwowie // Wokół przyrodniczych pasji Dzieduszyckich. – Zarzecze, 2021. – 51-62.
- Bokotey A.A., Dziubenko N.V., Strus. I.M. 2021. What is wrong with the protection zone of a 1 km radius around Black Stork Ciconia nigra nests? SIS Conservation 3: 44-49.
- Bokotey A., Dzyubenko N., Susułowśka I. Przyrodnicza część Biblioteki Poturzyckiej w księgozbiorze Państwowego Muzeum Przyrodniczego Narodowej Akademii Nauk Ukrainy we Lwowie: jej przeszłość i teraźniejszość // Wokół przyrodniczych pasji Dzieduszyckich. – Zarzecze, 2022. – S. 130-149.
- Загороднюк І., Харчук С., Улюра Є., Ільюхін Ю., Олійник Ю., Крон А., Шидловський І., Питель-Гута С., Бокотей А., Пономаренко О., Харчук Л. Колекції котових (Felidae) у природничих музеях України та їх значення у поширенні природничих знань. Geo&Bio, 2022, vol. 23, 15–52.
- Bokotey A., Savytska A., Rizun V. Catalogue of Felidae (Mammalia) family specimens deposited in the State Museum of Natural History NASU, Lviv, Ukraine // Catalogue of the digitized collections, deposited in the State Museum of Natural History, National Academy of Science of Ukraine. – 2023. – 1. – P. 226-245. DOI: https://doi.org/10.36885/cdcsmnh.2023.10.
- Бокотей А.А., Климишин О.С. Колекція тварин митрополита Йосифа Сліпого у фондах Державного природознавчого музею НАН України // Наукові записки Державного природознавчого музею НАН України. – 2023. – Вип. 39. – С. 13-18. DOI: https://doi.org/10.36885/nzdpm.2023.39.13-18
- Бокотей А., Мєдвєдєва І. Птахи // Дністровський регіональний ландшафтний парк імені Сергія Дідича / Ред. І.І. Дмитраш-Вацеба. – Івано-Франківськ: Лілея-НВ, 2023. – С 76-80.
- Бокотей А.А., Дзюбенко Н.В. План дій щодо збереження чорного лелеки Ciconia nigra в Україні: очікування та реалії // Біорізноманіття, екологія та експериментальна біологія, 2023, Том 25, №2. С. 21-28. https://doi.org/10.34142/2708-5848.2023.25.2.03